一、根据除草剂作用机理的不同，主要表现在对植物本身酶的合成和对土壤根系的危害
1、茎叶处理剂，茎叶处理剂指用于杂草苗后，施用在杂草茎叶上而起作用的除草剂，如草甘膦、百草枯。
草甘膦是一种广谱灭生性茎叶处理除草剂，内吸传导性较强，能够通过植物叶片和非木质化的植物茎杆吸收，传导到植物全株的各部位，特别是根部。基于草甘膦的除草剂可以抑制植物生长所需要的一种特定的酶--EPSP（5-烯醇丙酮莽草酸-3-磷酸）合成酶，从而抑制莽草素向苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸的转化，使蛋白质的合成受到干扰，随后植物就会变黄，并在数天或数周的时间里死亡。百草枯为速效触杀型灭生性季胺盐类除草剂。有效成分对叶绿体层膜破坏力极强，使光合作用和叶绿素合成很快中止，叶片着药后２-３小时即开始受害变色，百草枯对单子叶和双子叶植物绿色组织均有很强的破坏作用，但无传导作用，只能使着药部位受害，不能穿透栓质化的树皮，接触土壤后很容易被钝化。不能破坏植株的根部和土壤内潜藏的种子，因而施药后杂草有再生现象，是一种快速灭生性除草剂，具有触杀作用和一定内吸作用，能迅速被植物绿色组织吸收，使其枯死。
除草剂对绿色植物都有毒性。随着药液的蒸腾和随风飘散，药液被植物叶片吸收并传导到各个组织，一方面在叶片上直接形成病斑，严重时整个叶片干枯、脱落；另一方面造成叶片皱缩、畸形，阻碍叶绿素形成，抑制光合作用，而且这种药害症状的持续时间很长，短期内难以恢复。
据国外研究报导，频繁使用除草剂4年后，细胞原生质的渗透性发生变化，细胞胶体结构发生变异，一个月后才能恢复；频繁使用7年后，细胞原生质渗透性产生不可逆转的破坏，电解质从细胞中的流出增加；第5年起作物叶绿素的含量下降18％～36％，色素合成降低，它和蛋白质-类酯的联系牢固性增加。第7～8年叶片中醣合成下降44％、茎中醣合成下降21％。例如草丁膦除草剂的作用靶标是谷氨酰胺合成酶，它能阻止氨的同化，干扰氮的正常代谢，氨的积累，致使光合作用停止，叶绿体结构破坏。
2、土壤处理剂，也叫做苗前封闭剂，施用于土壤中，通过杂草的根、芽鞘或下胚轴等部位吸收而发挥除草作用，可防除未出土杂草，对已出土的杂草效果差一些，一般在作物播前、播后苗前或移栽前施用，如乙草胺、异丙甲草胺、氟乐灵等。
长期频繁使用化学除草剂会破坏土壤肥力，根系生长受到抑制，根短而粗、根尖变厚、功能降低。强烈抑制土壤放线菌、固氮菌的活性，第5年起就成为不可逆；土壤中氨化菌的数量第8年起数量明显减少，且氨化菌的多样性和孢子活性降低。纤维素分解及氨基酸积累的活性下降，降低土地氧化还原过程中酶的活性，脱氢酶的活性下降特别大，到第8年脱氢酶的还原活性消失。
二、除草剂对绿色植物本身的危害
干扰植物体内激素的平衡，影响植物的形态发育。绝大部分除草剂都具有植物生长调节剂的作用。植物通过调节生长素的合成、降解、输入和输出速度以及共轭作用，来维持不同组织中生长素的正常水平。激素型除草剂处理植物后，使植物组织中的激素（激素型除草剂）浓度极高，而干扰植物体内激素的平衡，影响植物的形态发育，严重时导致植物死亡。
抑制植物体脂肪和氨基酸的合成，脂类是植物细胞膜的重要组成成份。现已发现有多种除草剂能抑制脂肪酸的合成。有人反映，果园长期使用除草剂后，果树的叶片变小、丛生，开花少，结果少，果实也小，更容易感染病害。
抑制微管与组织发育，植物细胞的骨架主要是由微管和微丝组成。它们保持细胞形态，在细胞分裂、生长和形态发生中起着重要作用。很多除草剂直接干扰有丝分裂，使微管机能发生障碍形成多核细胞。
三、除草剂对周围环境的危害
长期频繁使用除草剂，引起土壤中分解这些除草剂的微生物数量增长，使田间敏感性杂草迅速减少，耐药性杂草滋生，更会诱导杂草产生抗药性，除草效果逐年下降，杂草群落加速向多年生难除群落演变。从第3～4年开始，由以一年生草为主向以多年生难除杂草为主演变；从第5～6年开始，根薜性的杂草、狗牙根逐渐广泛分布。
除草剂通过径流和渗透作用进一步污染地下水和水源，使污染范进一步围扩大，影响正常的农业生产和生活用水。
四、“除草剂”可危及人畜，使人畜的患病机率严重增加
美国一项环境调查表明，一种使用比较广泛而且使用时剂量较低的除草剂在今天已经极大地阻碍了青蛙正常的性发育，使得它们雄性变为雌性或变成不雌不雄的“阴阳蛙”。
人在食用喷施“除草剂”所产的粮食、果品时，也会在人体内蓄积有“除草剂”成分，无论其成分蓄积于人体的哪个脏器，都会给其脏器功能造成影响；此影响一旦超出极限立刻就会产生病变。人的机体免疫能力是个不相同的；也就是说不可能所有食用过药物除草的粮食的人都会发病，但我可以断定蓄积于人体内的“除草剂”成分定会给人的健康造成影响。近些年来人的脱发、各类白血病、各种肿瘤、肾坏死、股骨头坏死等各种病人的增多，绝大部分都与“除草剂”有关；特别是儿童和幼儿的白血病及肿瘤的增多，可断定与“除草剂”有直接关系。
为了人类的生存，为了自然环境的优美，为了万物同现，我们要认清除草剂的危害，让除草剂退出我们农业生产的舞台。
